研究者は約2,000の新しい腸内細菌を発見します
多くの最近の研究によると、人間の腸内細菌集団は、私たちの身体的および精神的健康のさまざまな側面に影響を与えることができます。それにもかかわらず、多くのバクテリアは科学者によって「マッピングされていない」ままです。新しい研究により、これまで知られていなかった約2,000の腸内細菌が発見されました。
によってカバーされる最近の研究 今日の医療ニュース 腸内細菌叢がパーキンソン病と認知症に関与している可能性があることを示しており、2型糖尿病治療薬が一部の人には効果的であるが他の人には効果がない理由を説明している可能性があります。
新しい研究—昨日ジャーナルに掲載されました 自然 —科学者がこれまで実験室で培養したことのない、約2,000の新しい腸内細菌種を特定しました。
英国のヒンクストンにあるEuropeanBioinformatics Institute（EMBL-EBI）とWellcome Sanger Instituteの研究者チームは、計算分析を使用して、世界中の参加者からの腸内細菌叢サンプルを評価しました。
「計算手法により、研究室ではまだ培養できない細菌を理解することができます」と、EMBL-EMIの研究著者であるRobFinnは説明します。
「メタゲノミクス[遺伝物質の分析]を使用して細菌ゲノムを再構築することは、最終的な画像がどのように見えるかを知らずに、すべてのピースを混ぜ合わせた後、いくつかのピースを完全に削除した後、何百ものパズルを再構築することに少し似ています。少し難しくするためだけに混ぜてください」と彼は続けます。
しかし、フィンはさらに次のように述べています。「研究者は、人間の腸への新しい洞察を明らかにするために、さまざまな計算ツールを使用してラボの作業を補完し、場合によってはガイドできる段階にあります。」
新しいアプローチ
チームは、11,850の多様な腸内細菌叢からのサンプルから92,143のゲノムを再構築することができました。
これにより、研究者たちは、この時点まで自分たちや他の人たちが知らなかった1,952種の腸内細菌を特定することができました。
Finnらは、科学者が腸内でそれらを非常に少数しか発見していないか、腸環境の外で生き残ることができないため、多くの細菌種がいわば「目立たない状態を維持している」と説明しています。
これは、これまでのところ、科学者がそのような種を彼らが知っている腸内細菌のリストに追加することを妨げてきたと彼らは指摘している。この理由は、現在の研究を実施したチームが新しいルートを取ることを決定した理由でもあります—そして計算方法の組み合わせを使用して人間の微生物叢のより包括的な「マップ」を考え出すことを試みます。
「計算手法により、人間の腸に生息する多くの細菌種、それらがどのように進化したか、そしてそれらが微生物群集内でどのような役割を果たしているかを知ることができます」と研究の共著者であるアレクサンドルアルメイダは述べています。
「堅実な青写真」の作成に向けて
「この研究では、胃腸内細菌の最も包括的な公開データベースを活用して、これまでに見られなかった細菌種を特定しました。私たちが使用した分析方法は再現性が高く、将来、より大規模で多様なデータセットに適用できるため、さらなる発見が可能になります。」
将来的には、この研究や同様の研究が人間の腸の理解をさらに助け、それがさまざまな状態のより良い治療法の開発に貢献することを研究者たちは望んでいます。
「このような研究は、人間の腸のいわゆる青写真を作成するのに役立ちます。これは、将来、人間の健康と病気をよりよく理解するのに役立ち、胃腸疾患の診断と治療を導くことさえできます。」
ウェルカムサンガーインスティテュートの研究共著者トレバーローリー
同時に、チームは、本研究により、研究者が腸内細菌に関する研究の大きなギャップをより認識できるようになったと述べています。
科学者たちは現在、ヨーロッパと北アメリカに生息するもの以外の集団の特徴である細菌種については比較的ほとんど知らない、と研究者らは強調している。
「ヨーロッパと北米の個体群からのデータには、同じ細菌種がたくさん出現しているのが見られます。しかし、この研究のためにアクセスできたいくつかの南アメリカとアフリカのデータセットは、以前の集団には存在しなかった重要な多様性を明らかにしました」とフィンは述べています。
「これは、人間の腸の構成の真に包括的な全体像を達成したいのであれば、過小評価された集団からデータを収集することが不可欠であることを示唆しています」と彼は付け加え、研究者に今後もより多様なコホートに焦点を合わせ続けるよう促します。
