前立腺がん：ビッグデータが80の新薬ターゲットのロックを解除

前立腺癌の遺伝学を分析するための最大の研究では、科学者は80以上の新しい潜在的な創薬ターゲットを見つけました。このプロジェクトは、新しい治療法の設計に幅広い道を開きます。

ビッグデータは、前立腺がんにアプローチするための新しい方法を提供します。

遺伝子データの抽出は、かつては面倒で信じられないほど時間のかかる作業でした。

しかし、テクノロジーが進歩し続けるにつれて、仕事は大幅に速く、安くなりました。

並行して、大規模なデータセットを処理するために利用できるツールが大幅に改善されました。

まとめると、これは、遺伝暗号から収集された情報の海を分析、マッピング、および比較的簡単に組み合わせて、新しいレベルの明快さを提供できることを意味します。

最近、国際的なチームが、DNA分析とビッグデータのこの二面的なアプローチを使用して、前立腺癌の遺伝学を調査しました。病気の鎧の分子のあごを探すために、研究はイギリスのロンドンにある癌研究所によって調整されました。

前立腺がんの課題

前立腺がんは、米国の男性の間で2番目に多いがんです。今年、米国では、推定164,690人の前立腺がんの新規症例と約30,000人の前立腺がんによる死亡が見込まれます。

研究者たちは前立腺癌の理解と治療を前進させてきましたが、それでも多くの困難があります。

研究リーダーのロザリンド・エーレス教授は、「癌研究で直面する課題の1つは、疾患の複雑さと、潜在的に治療できる方法の数の多さです」と説明しています。

Cancer ResearchU.K。のDr.Justine Alfordは、前立腺癌の研究と介入における別の問題について概説しています。

「前立腺がんに対してさらに進歩するための主要なハードルは、人の病気がどのように進行するかを正確に予測する方法がないことであり、各患者に最適な治療法を知ることは困難です」と彼女は説明します。

遺伝子データの収集

新しい方向から問題に取り組むために、研究者たちは前立腺癌の男性112人から遺伝子情報を取得し、それを他のさまざまな研究のデータと組み合わせました。全部で、930人の患者からのサンプルが使用されました。

チームは、最新のビッグデータ技術を使用して、前立腺がんの発生を促進し、進行を促進する遺伝子の変化に関する新しい洞察を獲得しました。どの遺伝子が関与しているかを理解すると、これらの遺伝子によってコードされるタンパク質のマップを作成できます。

次に、彼らはcanSARと呼ばれるデータベースに目を向けました。このデータベースは、研究からのデータを組み合わせ、機械学習を適用し、創薬への洞察を提供するのに役立ちます。

canSARは、彼らのWebサイトで、データベースが答えようとしている質問について説明しています。「タンパク質について知られていること、癌が発現または変異していること、およびその活性を実験的に調べるために使用できる化学ツールと細胞株モデルは何か。薬物、その細胞感受性プロファイル、および異常な生物活性を説明する可能性のある結合することが知られているタンパク質について何が知られていますか？」

科学者たちは、彼らが発見した80のタンパク質が潜在的な創薬ターゲットであることを発見しました。そして、これらのうち11は既存の薬の標的となり、他の7つはすでに臨床試験中の薬の標的となる可能性があります。

彼らの調査結果は今週ジャーナルに掲載されます ネイチャージェネティクス.